TRAzol
產(chǎn)品說明
TRAzol可以從動物組織、植物材料、各種微生物以及培養(yǎng)細(xì)胞等組織材料中提取總RNA。樣品在TRAzol中能夠充分被裂解,在加入氯仿離心后,溶液會形成上清層、中間層和有機(jī)層(下層),RNA分布在上清層中,收集上清層后,經(jīng)異丙醇沉淀便可以回收得到總RNA。經(jīng)本制品提取的總RNA純度高,基本不含蛋白質(zhì)及基因組DNA,提取的RNA可以直接用于Northern雜交、斑點(diǎn)雜交、mRNA純化、體外翻譯、RNA分解酶的保護(hù)分析、RT-PCR、構(gòu)建cDNA文庫等各種分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)。
產(chǎn)品組分
貨號 | R1021(20次) | R1022(100次) |
TRAzol | 20 ml | 100 ml |
說明書 | 1份 | 1份 |
需要自備氯仿、異丙醇、RNase-free 75%乙醇、DEPC處理水(R2041/R2042)
保存條件
室溫運(yùn)輸,2-8℃避光保存。
注意事項(xiàng)
● TRAzol具有腐蝕性,操作過程中應(yīng)做好防護(hù),避免直接接觸皮膚或吸入口鼻。沾染后應(yīng)立即用大量清水沖洗,必要時(shí)請就醫(yī)處理。
● 嚴(yán)防操作環(huán)境、使用的容器、耗材和試劑的RNase污染。操作過程中勤換手套。
● 根據(jù)起始材料量的不同使用不同體積的溶液(見下表)。過多或過少的使用量都可能影響RNA的質(zhì)量或產(chǎn)量。若起始材料量很少,RNA預(yù)計(jì)產(chǎn)量很低,在異丙醇沉淀時(shí),可加入20 mg/ml肝糖原溶液0.5-1 μl促進(jìn)RNA沉淀。
● 不同起始材料試劑用量及TRAzol用量。
樣品用量 | TRAzol的用量 |
10cm2的貼壁培養(yǎng)細(xì)胞 | 1 ml |
107的懸浮培養(yǎng)細(xì)胞 | 1-2 ml |
100 μl的白細(xì)胞 | 2 ml |
50-100 mg的普通組織樣品 | 1 ml |
50-100 mg的特殊組織樣品(肝、脾、骨及軟骨等) | 2 ml |
15-30 mg的植物材料(多糖和多酚含量不高的) | 1 ml |
● 使用本產(chǎn)品提取的RNA一般不含有DNA污染。在極少數(shù)情況下(與組織pH值等相關(guān)),如果有DNA污染而又必須去除,則可以用RNase-free的DNase處理樣品。
● 防止DNA污染方法:a. 減少樣本起始用量,如將100 mg的植物組織減少為50 mg,將30 mg的動物組織減少為10 mg;
b. 在加入TRAzol之后加入5-10 ul 3M NaAc(pH5.2)。
● 請嚴(yán)格遵照操作步驟操作。
● 有關(guān)RNA的吸光度說明如下:
260 nm、320 nm、230 nm、280 nm下的吸光度分別代表了核酸、背景(溶液渾濁度)、鹽濃度和蛋白質(zhì)等有機(jī)物的吸光度值。OD260/OD280(R)體現(xiàn)了RNA中的蛋白質(zhì)等有機(jī)物的污染程度,質(zhì)量較好的RNA的R值應(yīng)在1.8-2.0之間,當(dāng)R<1.8時(shí),溶液中的蛋白質(zhì)等有機(jī)物的污染比較明顯;當(dāng)R>2.2時(shí),說明RNA已經(jīng)被水解成了單核苷酸。在對核酸進(jìn)行吸光度檢測時(shí),需要注意稀釋液應(yīng)使用TE Buffer。
● RNA濃度=(OD260-OD320)×稀釋倍數(shù)×0.04 μg/μl
操作步驟
1. 實(shí)驗(yàn)樣品的研磨和勻漿
A. 貼壁培養(yǎng)細(xì)胞
倒出培養(yǎng)液,用1X PBS清洗一次,每10 cm2生長的培養(yǎng)細(xì)胞中加入1ml的TRAzol,水平放置片刻,使裂解液均勻分布于細(xì)胞表面并裂解細(xì)胞,然后使用移液槍吹打細(xì)胞使其脫落(對于貼壁牢固的培養(yǎng)細(xì)胞可用細(xì)胞刮勺剝離細(xì)胞)。將內(nèi)含細(xì)胞的裂解液轉(zhuǎn)移至離心管中,用移液槍反復(fù)吹吸直至裂解液中無明顯沉淀。室溫靜置5 min。
B. 懸浮培養(yǎng)細(xì)胞
將懸浮培養(yǎng)細(xì)胞連同培養(yǎng)液一起倒入離心管中,8,000 rpm,4℃離心2 min,棄上清,向每107個(gè)細(xì)胞中加入l-2 ml的TRAzol。用移液槍反復(fù)吹吸直至裂解液中無明顯沉淀,室溫靜置5 min。
C. 動物組織、植物材料樣品
將超低溫凍結(jié)的RNA提取樣品稱量后迅速轉(zhuǎn)移至用液氮預(yù)冷的研缽中,用研杵研磨組織,其間不斷加入液氮,直至研磨成粉末狀(無明顯的可見顆粒,如果沒有研磨徹底會影響RNA的收率和質(zhì)量)。對于普通的RNA提取樣品,可以向研缽中加入適量的TRAzol,將研磨成粉末狀的樣品完全覆蓋,然后室溫靜置,直至樣品完全融化,再用研杵繼續(xù)研磨至裂解液呈透明狀。對于特殊樣品,如肝、脾、骨及軟骨等,可以將研磨成粉末狀的樣品加入到含有適量的TRAzol的勻漿管中,把勻漿管置于冰浴中進(jìn)行勻漿,直至勻漿液呈無顆粒透明狀。將勻漿液轉(zhuǎn)移至離心管中,室溫靜置5 min。12,000 rpm 4 ℃離心5 min,小心吸取上清液,移入新的離心管中(切勿吸取沉淀)。
2. Total RNA的提取
1 向上述步驟中的勻漿裂解液中加入氯仿(TRAzol的1/5體積量),蓋緊離心管蓋,用力振蕩(氯仿沸點(diǎn)低、易揮發(fā),振蕩時(shí)應(yīng)小心離心管蓋突然彈開)。待充分乳化溶液呈乳白狀(無分相現(xiàn)象)后,再室溫靜置2 min。
2 12,000 rpm 4 ℃離心10 min。
3 從離心機(jī)中小心取出離心管,此時(shí)勻漿液分為三層,即:無色的上清液、中間的白色層及帶有顏色的下層有機(jī)相,吸取上清液轉(zhuǎn)移至另一新的離心管中(切忌吸出白色中間層)。
(如樣品含有較多多糖多酚,請?jiān)黾右韵虏襟E:在上清液中加入0.2X上清液體積的5 M NaCl及1X上清液體積的酚/氯仿(1:1),混勻,12000 rpm離心5-10 min ,取上清液加入等體積氯仿,混勻,12000 rpm 離心 5-10 min,至第4步。)
4 向上清中加入等體積的異丙醇,上下顛倒離心管充分混勻后,在15-30℃下靜置10 min。
5 12,000 rpm 4℃離心10 min。一般在離心后,試管底部會出現(xiàn)沉淀。
3. RNA沉淀的清洗
小心棄去上清,緩慢地沿離心管壁加入75%的乙醇1 ml(切勿觸及沉淀),輕輕上下顛倒洗滌離心管管壁,12,000 rpm,4 ℃離心2 min后小心棄去乙醇(為了更好地控制RNA中的鹽離子含量,應(yīng)盡量除凈乙醇),重復(fù)洗滌一次。
4. RNA的溶解
室溫干燥沉淀2-5 min(不可以離心或加熱干燥,否則RNA將會很難溶解),加入適量的RNase-free水溶解沉淀,必要時(shí)可用移液槍輕輕吹打沉淀,待RNA沉淀完全溶解后于-80℃保存。