FS? Mix Direct for Tissue
Cat. #:P2071b,P2072b
產(chǎn)品簡(jiǎn)介
FS? Mix Direct for Tissue是適合組織樣本擴(kuò)增的2×濃縮快速高效PCR預(yù)混合溶液,含有FS? Taq DNA聚合酶、dNTP混合物、緩沖液等PCR擴(kuò)增必需組分(模板與引物除外)。使用時(shí),僅需在擴(kuò)增體系中加入簡(jiǎn)單處理后的樣本處理液和引物即可進(jìn)行PCR,從而可以極大地簡(jiǎn)化操作過程,縮短操作時(shí)間,降低污染(加樣次數(shù)減少)。FS? Mix Direct for Tissue的反應(yīng)體系經(jīng)過優(yōu)化處理,高靈敏度的FS? Taq DNA聚合酶確保處理液中的微量樣本得到高效擴(kuò)增。本產(chǎn)品不用進(jìn)行繁瑣的DNA提取,最大限度減少實(shí)驗(yàn)誤差和交叉污染;同時(shí)依靠特殊的緩沖體系增強(qiáng)PCR擴(kuò)增的特異性,保證擴(kuò)增效果與DNA模板擴(kuò)增效果同樣可靠。
FS? Taq DNA聚合酶是根據(jù)蛋白工程原理,以Taq DNA聚合酶為基礎(chǔ),研發(fā)設(shè)計(jì)的新一代DNA聚合酶。本產(chǎn)品具有類似KOD酶的快速擴(kuò)增能力,延伸速度為20s/kb(70~75℃,簡(jiǎn)單模板可達(dá)5s/kb)。是普通Taq DNA聚合酶的3倍,可縮短一半以上的擴(kuò)增時(shí)間;同時(shí)具備Taq DNA聚合酶擴(kuò)增效率高、適應(yīng)性廣等優(yōu)點(diǎn)。FS? Taq DNA聚合酶使用方法與普通Taq DNA聚合酶基本相同,只需注意適當(dāng)縮短延伸時(shí)間。該酶具有5'→3'聚合酶活性,無3'→5'外切酶活性。擴(kuò)增產(chǎn)物具有3'-dA突出端,可直接用于TA克隆。
產(chǎn)品組成
Component | P2071b | P2072b |
2× FS? Mix Direct for Tissue | 1 ml | 1 ml× 5 |
超純水 | 1 ml | 1 ml× 5 |
Neutralization Solution | 1 ml | 5 ml |
Extraction Solution | 10 ml | 40 ml |
本產(chǎn)品分體系中包含溴酚藍(lán)、不含溴酚藍(lán)兩類。體系中包含溴酚藍(lán)的產(chǎn)品,PCR擴(kuò)增產(chǎn)物可直接電泳檢測(cè)。這兩類產(chǎn)品的擴(kuò)增性能無差異。如無特別說明提供體系中包含溴酚藍(lán)的包裝。
保存條件
-20℃保存2年。
質(zhì)量控制
純度檢測(cè):經(jīng)質(zhì)量檢測(cè),產(chǎn)品不含脫氧核糖核酸內(nèi)切酶、脫氧核糖核酸外切酶和核糖核酸酶污染。
功能檢測(cè):PCR方法檢測(cè)無宿主殘余DNA,能有效擴(kuò)增人基因組中的單拷貝基因。
應(yīng)用舉例
1. 處理樣品
組織:取3-5mg組織置于1.5ml離心管中,加入180 μl Extraction Solution,充分渦旋振蕩,95℃溫浴10min。加入20 μl Neutralization Solution,充分渦旋振蕩,5,000rpm離心2min,取0.5-2 μl上清進(jìn)行擴(kuò)增。
頭發(fā):取兩根帶毛囊的頭發(fā),剪下帶毛囊的發(fā)根放入1.5ml離心管中,加入180 μl Extraction Solution,充分渦旋振蕩,95℃溫浴10min。加入20 μl Neutralization Solution,充分渦旋振蕩,5000rpm離心2min,取0.5-2 μl上清進(jìn)行擴(kuò)增。
口腔拭子:取樣前30min內(nèi)請(qǐng)勿進(jìn)食及飲水,使用無菌棉簽在口腔內(nèi)擦拭10次。將棉球剪下置于1.5ml離心管中,加入180 μl Extraction Solution,充分渦旋振蕩,95℃溫浴10min。加入20 μl Neutralization Solution,充分渦旋振蕩,5,000rpm離心2min,取0.5-2 μl上清進(jìn)行擴(kuò)增。
培養(yǎng)細(xì)胞:如果是懸浮培養(yǎng)細(xì)胞直接取1×103-104當(dāng)量的細(xì)胞加入到50 μl PCR反應(yīng)體系中即可。如果是貼壁培養(yǎng)細(xì)胞,取3-5mg細(xì)胞組織置于1.5ml離心管中,加入180 μl Extraction Solution,充分渦旋振蕩,95℃溫浴10min。加入20 μl Neutralization Solution,充分渦旋振蕩,5,000rpm離心2min,取0.5-2 μl上清進(jìn)行擴(kuò)增。
血液、淋巴液DNA病毒:取100 μl血清或淋巴液至1.5ml離心管中,加入180 μl Extraction Solution,充分渦旋振蕩,95℃溫浴10min。加入20 μl Neutralization Solution,充分渦旋振蕩,12,000rpm離心10min,取0.5-2 μl上清進(jìn)行擴(kuò)增。
2. 配制反應(yīng)體系
請(qǐng)于冰上配置反應(yīng)體系,體系大小與組分用量與添加順序可調(diào)整:
Ordinal | Component | Volume (50 μl reaction volume) | Final concentration (50 μl reaction volume) |
1 | 2× FS? Mix Direct for Tissue | 25 μl | 1× |
2 | upstream primer (10 μM)[1] | 2 μl | 0.4 μM |
3 | downstream primer (10 μM)[1] | 2 μl | 0.4 μM |
4 | 處理液上清 | 0.5-2 μl | <1μg |
5 | 超純水[2] | To 50 μl | - |
optional | MgCl2(MgSO4)/PCR Enhancer[3] | Variable | - |
[1] 引物終濃度建議范圍:0.1-1 μM。特異性差時(shí)可降低濃度,效率低時(shí)可提高濃度。
[2] 可單獨(dú)訂購超純水(Cat. #:P9021/P9022/P9023)。
[3] 可單獨(dú)訂購25mM MgCl2(Cat. #:P9031)和PCR Enhancer(Cat. #:P9041)。
3. 設(shè)定反應(yīng)程序進(jìn)行PCR反應(yīng)
大多數(shù)模板的快速擴(kuò)增條件:
Stage | Temperature | Time | Number of Cycles |
Initial Denaturation | 94℃ | 3 min | 1 |
Denaturation | 94℃ | 30 sec | 28-40 |
Annealing | 55-68℃[1] | 30 sec | |
Extension | 72℃ | Variable[2] | |
Final Extension | 72℃ | 2 min | 1 |
[1] 退火溫度應(yīng)根據(jù)Tm值較低的引物來設(shè)。
[2] 延伸時(shí)間按20 sec/kb來設(shè)最佳。
1kb簡(jiǎn)單模板的快速擴(kuò)增條件:
由于1kb簡(jiǎn)單模板的二級(jí)結(jié)構(gòu)簡(jiǎn)單,且長(zhǎng)度較短,可同時(shí)縮短變性、退火時(shí)間至15s,延伸時(shí)間20s,以實(shí)現(xiàn)快速擴(kuò)增。
4. 分析結(jié)果
反應(yīng)產(chǎn)物可直接進(jìn)行瓊脂糖凝膠電泳,通過凝膠成像設(shè)備觀察目的條帶的擴(kuò)增情況。如有需要,可進(jìn)行割膠回收。無產(chǎn)物或產(chǎn)物量少的改進(jìn)措施有:1調(diào)整退火溫度;2減少抑制劑的影響,如提取的基因組DNA中含有抑制擴(kuò)增的成分,需要高倍稀釋(1: 10000)后使用;3采用乙醇沉降洗脫,提高模板DNA的純度;4使用PCR添加劑,如PCR Enhancer(Cat. #:P9041)、MgCl2(Cat. #:P9031)等可提高產(chǎn)量。
操作注意事項(xiàng)
處理的組織樣本往往不會(huì)完全溶解,這是正?,F(xiàn)象。溶解在處理液中的組織樣本足夠滿足FS? Mix Direct for Tissue擴(kuò)增的需要。
室溫下FS? Taq DNA聚合酶有一定的活性,為避免發(fā)生非特異性擴(kuò)增,請(qǐng)于冰上配置反應(yīng)體系,并且最后添加模板DNA。
延伸時(shí)間視片段長(zhǎng)度而定。一般情況,≤500bp目的片段延伸15s,500bp-1kb延伸20s,>1kb延伸時(shí)間按20s/kb計(jì)算。
FS? Taq DNA聚合酶具有脫氧核苷酸轉(zhuǎn)移酶活性,因此在PCR產(chǎn)物3’末端通常會(huì)加上一個(gè)多余的脫氧腺嘌呤核苷,可進(jìn)行TA克隆。
FS? Mix Direct for Tissue也可采用常規(guī)程序擴(kuò)增。
引物設(shè)計(jì)注意事項(xiàng)
引物長(zhǎng)度一般在15-30個(gè)堿基之間;上下游引物3’末端避免互補(bǔ),避免出現(xiàn)3個(gè)以上重復(fù)的G或C,或出現(xiàn)發(fā)夾結(jié)構(gòu),否則會(huì)產(chǎn)生非特異性擴(kuò)增;GC含量控制在40-60%,且上下游引物GC含量盡量接近;Tm值控制在55-65℃之間,且上下游引物Tm值盡量接近,額外附加序列(酶切位點(diǎn)、修飾等)是非模板匹配序列,不參與Tm值計(jì)算。
相關(guān)產(chǎn)品
名稱 | 貨號(hào) | 規(guī)格 |
PCR Mix | P2011/P2012/P2013/P2014/P2015 | 1ml/5ml/10ml/50ml/100ml |
Power Green qPCR Mix | P2101/P2102/P2103/P2104/P2105 | 1ml/5ml/10ml/50ml/100ml |
1kb ladder | M1181/M1182 | 50次/250次 |
DSTM5000 | M1111/M1112 | 60次/300次 |
高純度質(zhì)粒小提試劑盒 | N1011/N1012/N1013 | 50次/100次/200次 |
通用RNA提取試劑盒 | R1051 | 50次 |
基因組DNA快速提取試劑盒 | N1111/N1112 | 50次/100次 |
DNA凝膠回收試劑盒 | N1071/N1072/N1073 | 50次/100次/200次 |
RT-PCR Kit | R1011/R1012 | 20次/100次 |
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