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技術(shù)分享丨KASP:精準(zhǔn)農(nóng)業(yè)的革新者

欄目:技術(shù)分享 發(fā)布時(shí)間:2024-04-22
在精準(zhǔn)農(nóng)業(yè)的浪潮中,KASP技術(shù)以其獨(dú)特的優(yōu)勢(shì),正成為作物遺傳研究和分子育種的重要工具。今天,我們將深入了解KASP技術(shù),并探討它如何在水稻抗瘟病育種等分子育種中發(fā)揮關(guān)鍵作用。


KASP技術(shù)簡(jiǎn)介


KASP(Kompetitive Allele Specific PCR,競(jìng)爭(zhēng)性等位基因特異性PCR)是一種基于單核苷酸多態(tài)性(SNP)的高通量基因分型技術(shù)。它利用等位基因特異性引物,實(shí)現(xiàn)對(duì)目標(biāo)基因位點(diǎn)的精確識(shí)別,能夠從基因組水平對(duì)SNP和插入缺失多態(tài)性(InDel)進(jìn)行精準(zhǔn)分型。在PCR擴(kuò)增過(guò)程中,只有與目標(biāo)DNA匹配的引物或探針才能有效擴(kuò)增并產(chǎn)生熒光信號(hào)。通過(guò)檢測(cè)特定的熒光信號(hào),可以確定樣本的基因型。它支持從低到高通量的SNP檢測(cè),尤其適合于功能基因的準(zhǔn)確分型,為優(yōu)良性狀的定向改良育種提供了強(qiáng)有力的工具。



KASP技術(shù)的優(yōu)勢(shì)


1. 高通量和靈活性:KASP技術(shù)能夠適應(yīng)低、中、高通量的基因分型需求,適合在不同規(guī)模的研究中應(yīng)用。


2. 低成本:相比于其他基因分型技術(shù),如TaqMan探針?lè)ǎ琄ASP技術(shù)使用的是通用探針,減少了針對(duì)每個(gè)特定位點(diǎn)進(jìn)行探針合成的成本,商業(yè)服務(wù)成本大幅降低。

3. 高準(zhǔn)確度:KASP技術(shù)準(zhǔn)確度極高,其檢出率超過(guò)99.5%,與常規(guī)qPCR檢測(cè)準(zhǔn)確度一致,適用于需要高精度基因分型的場(chǎng)合。

4. 簡(jiǎn)單快捷的結(jié)果分析:實(shí)驗(yàn)操作簡(jiǎn)便,對(duì)設(shè)備要求較低,普通分子實(shí)驗(yàn)室即可滿足實(shí)驗(yàn)要求,且結(jié)果易于分析。

5. 高效率:KASP技術(shù)能在短時(shí)間內(nèi)對(duì)大量樣本進(jìn)行基因分型,極大提高了工作效率。

6. 特異性引物和探針:使用的特異性引物和探針可以減少技術(shù)誤差,提高基因分型的準(zhǔn)確性。

7. 穩(wěn)定性高:KASP PCR Mix含有雙抗體修飾的熱啟動(dòng)型Taq DNA聚合酶,實(shí)現(xiàn)零背景PCR,提高了實(shí)驗(yàn)的穩(wěn)定性。

8. 高靈敏度:KASP技術(shù)可實(shí)現(xiàn)快速、準(zhǔn)確以及高通量的基因分型,適合于各種生物體的基因分型,包括人類、動(dòng)物、植物等。

9. 廣泛的應(yīng)用范圍:KASP技術(shù)已在農(nóng)作物分子標(biāo)記輔助育種、種質(zhì)資源鑒定、遺傳圖譜構(gòu)建和種子純度鑒定等領(lǐng)域得到廣泛應(yīng)用。

10. 適用于復(fù)雜基因組:KASP技術(shù)可以對(duì)包括復(fù)雜基因組DNA樣品在內(nèi)的各種基因組DNA樣品進(jìn)行精準(zhǔn)的雙等位基因分型。


KASP技術(shù)應(yīng)用分析

以下是幾篇論文討論了KASP技術(shù)及其在不同作物遺傳研究中的應(yīng)用:

1. KASP技術(shù)在水稻抗瘟病育種中的應(yīng)用


在《Rice》期刊上發(fā)表的一項(xiàng)研究中,科學(xué)家們針對(duì)水稻Pi2基因開(kāi)發(fā)了KASP分子標(biāo)記。Pi2基因?qū)Φ疚敛【哂袕V譜抗性,是水稻抗瘟病育種的關(guān)鍵基因。


研究亮點(diǎn)

  • 精準(zhǔn)分型:KASP技術(shù)能夠準(zhǔn)確區(qū)分Pi2基因位點(diǎn)的不同基因型,包括抗病、雜合和感病基因型。
  • 高效篩選:通過(guò)KASP分子標(biāo)記,研究人員能夠快速篩選出含有Pi2基因的材料,為育種提供了便利。

應(yīng)用分析

  1. 育種效率提升:KASP技術(shù)的應(yīng)用大幅提高了抗瘟病水稻品種的篩選效率。
  2. 成本降低:與傳統(tǒng)的分子標(biāo)記技術(shù)相比,KASP技術(shù)顯著降低了育種成本。
  3. 育種周期縮短:快速準(zhǔn)確的基因分型能力,縮短了新品種的培育周期。


2. 基因組片段追蹤技術(shù)實(shí)現(xiàn)包心芥菜的性狀改良
該研究通過(guò)遠(yuǎn)緣雜交和分子標(biāo)記輔助育種技術(shù),將白菜基因組片段滲入芥菜基因組,從而提高了芥菜的遺傳多樣性并改良了其結(jié)球性狀。研究團(tuán)隊(duì)開(kāi)發(fā)了一套KASP標(biāo)記,用于追蹤白菜基因組片段在芥菜基因組中的滲入情況。這些標(biāo)記有助于改良包心芥菜的結(jié)球性狀,使其更緊密、產(chǎn)量更高。研究結(jié)果表明,芥菜滲入系的遺傳變異幅度擴(kuò)大了近10倍,為芥菜遺傳改良提供了新的材料和方法。



    3.其他作物中KASP標(biāo)記技術(shù)的應(yīng)用
    除了水稻和芥菜,KASP技術(shù)也被廣泛應(yīng)用于其他作物的遺傳研究和分子育種中。例如,在玉米自交系的全基因組重測(cè)序研究中,利用KASP標(biāo)記技術(shù)進(jìn)行SNP分型,有助于作物改良和遺傳研究。此外,KASP技術(shù)因其成本效益和高通量特性,被用于商業(yè)植物育種中,尤其是在處理多倍體植物時(shí),KASP技術(shù)能夠有效地將有效的SNP轉(zhuǎn)化為可用的標(biāo)記。
    這些論文展示了KASP技術(shù)在現(xiàn)代農(nóng)業(yè)生物技術(shù)領(lǐng)域中的重要性,特別是在分子標(biāo)記輔助育種、基因分型以及遺傳多樣性分析等方面。通過(guò)KASP技術(shù),研究人員能夠更高效地進(jìn)行作物改良,提高作物的產(chǎn)量和抗病性,為現(xiàn)代農(nóng)業(yè)生產(chǎn)提供技術(shù)支持。


    結(jié)論與展望


    KASP技術(shù)在水稻抗瘟病育種中的應(yīng)用,不僅提高了育種的精準(zhǔn)度和效率,還為其他作物的分子育種提供了新的思路。隨著技術(shù)的不斷進(jìn)步和應(yīng)用范圍的擴(kuò)大,KASP技術(shù)有望在精準(zhǔn)農(nóng)業(yè)領(lǐng)域扮演更加重要的角色。

    東盛相關(guān)產(chǎn)品
    東盛生物針對(duì) KASP 技術(shù)開(kāi)發(fā)了多款 PCR Mix 溶液,含有雙抗體修飾的熱啟動(dòng)型Taq DNA 聚合酶、dNTPs、緩沖液等 PCR 擴(kuò)增必需組分。產(chǎn)品具有使用方便、性能優(yōu)越、成本低等優(yōu)勢(shì),支持申請(qǐng)?jiān)囉谩?/span>

    - end -

    東盛生物簡(jiǎn)介
    廣州東盛生物科技有限公司成立于2005年,坐落于廣州市黃埔區(qū)科學(xué)城,是一家專注于研發(fā)、生產(chǎn)、銷售優(yōu)質(zhì)生命科學(xué)產(chǎn)品的高新技術(shù)企業(yè)。東盛以PCR技術(shù)為核心,聚焦于普通PCR、熒光定量PCR、NGS建庫(kù)、核酸電泳等分子生物學(xué)技術(shù),開(kāi)發(fā)了一系列優(yōu)質(zhì)的分子科研試劑及IVD診斷原料。
    自2010年起,東盛分別通過(guò)ISO9001及ISO13485質(zhì)量管理體系認(rèn)證,并開(kāi)拓海外市場(chǎng),客戶遍布全球各個(gè)地區(qū)。產(chǎn)品以穩(wěn)定、優(yōu)秀的質(zhì)量贏得了大批忠實(shí)客戶。
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